工藤(téng )新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被(bèi )团伙(huǒ )成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新(xīn )一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少(shǎo )间谍武器。为了(le )防止犯罪团伙对(duì )他进行(háng )报复(fù )，新一决(jué )定(dìng )隐(yǐn )姓埋名(míng )，暗中追查他们，希望能得到解药。一(yī )日，新一 的(de )女友(yǒu )毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男(nán )友的下落，被小兰撞(zhuàng )见的新(xīn )一情(qíng )急(jí )之下编造了自己名叫江户川柯(kē )南，随后(hòu )柯南(nán )寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五(wǔ )郎(láng )是一(yī )名私(sī )家(jiā )侦探，新一可(kě )以籍(jí )着和他(tā )一起四(sì )出办案一起追查黑夜人的下(xià )落。柯(kē )南(nán )在小学认识步美等小学生，他们(men )一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战(zhàn )！