工藤新(xīn )一是全国著名的高中生侦探，在一(yī )次追查黑衣人犯罪团伙时(shí )不幸被团(tuán )伙成员发现，击晕后喂了神奇(qí )的药(yào )水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助(zhù )他(tā )的阿笠博士，博士(shì )为(wéi )他(tā )度身打造不少间谍武(wǔ )器。为了防止犯罪(zuì )团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他(tā )们(men )，希望能(néng )得(dé )到解(jiě )药。一日，新(xīn )一 的女友毛利兰来到了阿笠博(bó )士的家寻找男友(yǒu )的下落，被小兰撞见的新(xīn )一情急之下编造(zào )了(le )自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父(fù )亲毛利小五郎是(shì )一名私家侦(zhēn )探，新一可以籍着和他一起四出办(bàn )案一起追查黑夜人的下落(luò )。柯南在小学认识步(bù )美(měi )等(děng )小(xiǎo )学生，他们(men )一起组织了一个少年侦探(tàn )团(tuán )，向罪犯宣战！