工(gōng )藤(téng )新一(yī )是(shì )全国著(zhe )名的高中生侦探，在一次追(zhuī )查黑衣人犯(fàn )罪团伙(huǒ )时不幸被(bèi )团伙成员发现(xiàn )，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变(biàn )回了小孩！新一找到(dào )了经常帮助(zhù )他的阿笠博士，博士为他度身打造不少(shǎo )间谍武器。为(wéi )了防止犯罪团伙对(duì )他进行报复(fù )，新一决定隐姓(xìng )埋名，暗中(zhōng )追查他(tā )们，希望(wàng )能得到解药。一日，新一 的(de )女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之(zhī )下编(biān )造了自己(jǐ )名叫江(jiāng )户川柯(kē )南，随后柯南(nán )寄居在了小兰家。小兰的父(fù )亲毛利小五郎是一名(míng )私家侦探，新一(yī )可以籍着和他一起(qǐ )四出办(bàn )案一起追查黑夜(yè )人(rén )的下落。柯南在小学认识步美(měi )等小学生，他(tā )们一起组织了(le )一个少年侦探团，向罪犯宣战！