工(gōng )藤新一是全(quán )国著名的高中生侦探，在一次追查黑(hēi )衣(yī )人犯(fàn )罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水(shuǐ )，工藤(téng )新(xīn )一变回(huí )了小孩！新一找到了经(jīng )常帮助他(tā )的(de )阿笠博士，博士为他度身打造(zào )不(bú )少间谍武器。为了防止犯罪团伙(huǒ )对他进行报复，新(xīn )一决定(dìng )隐姓埋名(míng )，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿(ā )笠博士的家(jiā )寻找男友的下落(luò )，被小兰(lán )撞见的新一情(qíng )急之下编造了自己名叫江户川柯南(nán )，随后柯南寄居(jū )在(zài )了(le )小兰家。小兰的父亲(qīn )毛利小五郎是一名(míng )私(sī )家侦探，新一可以(yǐ )籍着和他一起四出办案(àn )一(yī )起追查黑夜人的下落(luò )。柯南在小学认(rèn )识步(bù )美等小学生，他们一起组织了一个少(shǎo )年侦(zhēn )探(tàn )团，向罪(zuì )犯宣(xuān )战！