工藤新一是全国著名的高(gāo )中生侦探，在一次追查(chá )黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后(hòu )喂了神奇的药水，工藤新一变(biàn )回了小孩(hái )！新(xīn )一找到了经常(cháng )帮助他的阿笠博士，博士为他度身(shēn )打(dǎ )造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对(duì )他进行报复，新一决定(dìng )隐姓(xìng )埋名(míng )，暗中追查他(tā )们(men )，希(xī )望能得到解药。一(yī )日，新一 的(de )女友(yǒu )毛(máo )利兰来到(dào )了(le )阿笠博士的家寻(xún )找男友的下(xià )落，被(bèi )小兰撞见(jiàn )的新(xīn )一情急之下编(biān )造了自己名叫江户川柯南(nán )，随后柯(kē )南寄(jì )居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一(yī )名私家侦探，新一可以籍着和(hé )他一起四出办(bàn )案一起追查黑夜人(rén )的下落(luò )。柯南在小学认(rèn )识步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪(zuì )犯宣战！