工藤(téng )新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时(shí )不幸(xìng )被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤(téng )新一变回(huí )了(le )小(xiǎo )孩！新(xīn )一(yī )找到了经常帮助(zhù )他的阿笠博士(shì )，博士为他度身打(dǎ )造不少间(jiān )谍(dié )武器。为了防止犯罪团伙对他进行报(bào )复，新一决定(dìng )隐姓埋(mái )名，暗中(zhōng )追查他们，希望(wàng )能得到解药。一日，新(xīn )一 的(de )女友毛利兰来到了阿笠博士(shì )的家寻找男友的下落，被小兰撞见的(de )新一(yī )情急之下(xià )编造了自(zì )己名叫江(jiāng )户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小(xiǎo )兰(lán )的父亲(qīn )毛利小五(wǔ )郎是一名私家(jiā )侦探，新一(yī )可以籍着和他一起四(sì )出办案一(yī )起追(zhuī )查黑夜人的下(xià )落。柯南在小学(xué )认识步美等小(xiǎo )学生，他们一起组织了一个少年侦(zhēn )探团，向罪犯宣战！