工藤(téng )新一是全国著名的(de )高中生侦探，在(zài )一次追查黑衣(yī )人犯罪团伙时(shí )不幸被团伙成员发现，击(jī )晕后喂了神奇(qí )的药水，工藤新(xīn )一变回(huí )了小孩！新一(yī )找(zhǎo )到了(le )经常(cháng )帮助他的阿笠(lì )博(bó )士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯(fàn )罪团伙对他(tā )进行报复(fù )，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希(xī )望能得到解药。一日，新一 的女友毛(máo )利兰来到了阿笠博士的家寻(xún )找男(nán )友的下落(luò )，被小兰(lán )撞见(jiàn )的新一情急之下编造(zào )了自己名叫(jiào )江户川柯南，随后(hòu )柯南寄居在了小兰家(jiā )。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦(zhēn )探，新一可以籍着(zhe )和他一起四出办案(àn )一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小(xiǎo )学生，他们一起(qǐ )组织(zhī )了一个少年侦探团，向(xiàng )罪犯宣战！