工藤新一是(shì )全国著名的高中生侦探，在一次追查(chá )黑衣人犯罪团(tuán )伙时不幸(xìng )被团(tuán )伙成(chéng )员发现，击晕后喂了神奇(qí )的(de )药水(shuǐ )，工藤新一变(biàn )回了(le )小孩！新一找到(dào )了经常帮助他的(de )阿笠博士(shì )，博士(shì )为(wéi )他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪(zuì )团(tuán )伙对他进行(háng )报(bào )复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们(men )，希望能得到解药。一日，新一(yī ) 的女友毛利兰来到了阿笠博士(shì )的家(jiā )寻(xún )找男友的下落，被小兰撞见(jiàn )的新一情(qíng )急之下编造了自己名叫江户川柯南，随(suí )后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎(láng )是一名私家侦探，新一可(kě )以籍(jí )着和他一起四出办案(àn )一起追查黑夜人的下(xià )落(luò )。柯南(nán )在小学(xué )认识步美等(děng )小学(xué )生，他们(men )一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！