工藤新一是全国著(zhe )名的高中生侦探(tàn )，在一次(cì )追查(chá )黑衣人犯罪团伙时(shí )不幸被(bèi )团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药(yào )水，工藤新(xīn )一变回了(le )小孩(hái )！新一找(zhǎo )到了经常帮助他的(de )阿笠博士，博士为(wéi )他度(dù )身(shēn )打造不少间谍武器。为了防止犯罪(zuì )团伙对(duì )他进行报复(fù )，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到(dào )解药(yào )。一日，新一 的女(nǚ )友毛利兰(lán )来到了阿(ā )笠博(bó )士的家寻找男友(yǒu )的下(xià )落，被小兰(lán )撞见的新一情急之下编造了自己名叫(jiào )江户川柯(kē )南，随后(hòu )柯南寄居在了小兰家。小兰的(de )父亲毛利小五(wǔ )郎是一名私家侦探，新(xīn )一可以籍着和他(tā )一起四出办案一起追(zhuī )查黑夜人的下落。柯(kē )南在小学认识步美等小学(xué )生，他们一起组织了一个少年侦探团，向(xiàng )罪犯宣战！