工藤新一是全国(guó )著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团(tuán )伙时不幸被(bèi )团伙成员发(fā )现，击晕后(hòu )喂了神奇的药水，工藤新一变回了小(xiǎo )孩！新一找到了(le )经常帮助(zhù )他的阿笠博士，博士为(wéi )他度身打造不少间(jiān )谍武器。为了防止(zhǐ )犯(fàn )罪团(tuán )伙对他(tā )进行(háng )报复，新一(yī )决定隐姓(xìng )埋名，暗(àn )中追查他们(men )，希(xī )望能得到解药。一(yī )日，新一 的(de )女友毛(máo )利兰来到了(le )阿笠(lì )博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南(nán )，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名(míng )私家侦探(tàn )，新一可以籍着和他一起四(sì )出办(bàn )案一(yī )起(qǐ )追(zhuī )查黑夜人(rén )的下落。柯南在小学认(rèn )识(shí )步美等小(xiǎo )学生，他(tā )们一起组(zǔ )织(zhī )了一个少年侦探团，向罪犯宣战！