工(gōng )藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追(zhuī )查黑衣人犯罪团(tuán )伙时不幸被团伙(huǒ )成员发现，击(jī )晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他(tā )度身打造不少间谍(dié )武器。为了防止犯罪团伙对他进(jìn )行报复，新一决定隐姓埋名，暗中(zhōng )追查他们，希望能(néng )得到解药。一日(rì )，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻(xún )找男友的(de )下落，被小兰撞(zhuàng )见的(de )新一情急之下编造(zào )了自己(jǐ )名(míng )叫江户川柯南，随后柯(kē )南(nán )寄居在了(le )小兰家。小兰的父(fù )亲毛利小五郎是一名私家侦探，新(xīn )一(yī )可(kě )以籍着和他一起四出办案一起(qǐ )追查(chá )黑(hēi )夜人的下落。柯南在小(xiǎo )学(xué )认识(shí )步美等小学生，他们一起组(zǔ )织了(le )一(yī )个少年侦探团(tuán )，向罪犯宣(xuān )战！