工(gōng )藤(téng )新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑(hēi )衣人犯罪团(tuán )伙时不幸被团伙(huǒ )成员发(fā )现，击晕后(hòu )喂了神奇的药水，工藤新一(yī )变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠(lì )博士，博士为他度身(shēn )打造不少间谍武器(qì )。为了(le )防止犯罪(zuì )团伙对他(tā )进行报复，新一决定(dìng )隐姓(xìng )埋名，暗中追查他们，希望能(néng )得到解药。一日，新一 的女友毛利兰(lán )来(lái )到了阿笠博士的家寻找男(nán )友的下(xià )落，被小兰撞见的新(xīn )一情急之下编(biān )造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家(jiā )。小兰的父亲毛利小五郎(láng )是(shì )一名私(sī )家侦探，新一可以籍着和他(tā )一起四(sì )出办案一起追查黑夜人的下落。柯(kē )南在小学(xué )认(rèn )识(shí )步美等小(xiǎo )学生，他们(men )一起组(zǔ )织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！