工藤新(xīn )一是(shì )全(quán )国著名的(de )高中(zhōng )生侦探(tàn )，在一次追查(chá )黑衣人犯(fàn )罪(zuì )团伙时不幸被团伙(huǒ )成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找(zhǎo )到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防(fáng )止犯罪团(tuán )伙(huǒ )对他进行报复，新一(yī )决定隐姓埋名，暗中追查他们，希(xī )望能(néng )得到解药。一日，新一 的女友毛(máo )利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落(luò )，被小兰(lán )撞见的新一情急之(zhī )下编造了自己(jǐ )名叫(jiào )江户川柯南，随后(hòu )柯南寄居在了(le )小兰家。小(xiǎo )兰的父亲(qīn )毛利小五郎是(shì )一名(míng )私家侦探(tàn )，新一可以籍着和他(tā )一起四出(chū )办案一(yī )起追查黑夜人的下落。柯南(nán )在小学认(rèn )识步(bù )美等小(xiǎo )学生，他们一起组织了一个少(shǎo )年侦探团，向罪犯宣战！