工藤新一是全(quán )国著名的高中生侦探，在一(yī )次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团(tuán )伙成(chéng )员发现(xiàn )，击(jī )晕后喂了神(shén )奇的(de )药水，工藤新一变(biàn )回了小孩！新一找(zhǎo )到了经(jīng )常帮助他(tā )的阿笠(lì )博士，博士为他度身打造不少间谍(dié )武器。为了防止犯罪团伙(huǒ )对(duì )他进行报复，新一决定隐姓(xìng )埋名，暗中追查他(tā )们，希望(wàng )能得到解药。一日(rì )，新一 的女友(yǒu )毛(máo )利兰来到(dào )了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一(yī )情急之下编造(zào )了自(zì )己名叫江户川柯南，随(suí )后柯(kē )南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小(xiǎo )五郎是一名私家侦探，新一可以籍(jí )着和他一起四出办案(àn )一起(qǐ )追查黑夜(yè )人的(de )下(xià )落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年(nián )侦探团，向罪犯宣(xuān )战！