工藤新一(yī )是(shì )全国(guó )著名的高中生侦探(tàn )，在一次追查(chá )黑衣人犯罪(zuì )团伙时不幸被(bèi )团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小(xiǎo )孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博(bó )士为他度(dù )身打造不少间谍武(wǔ )器。为了防止犯罪团伙对他进(jìn )行报复，新一决定(dìng )隐姓埋名，暗中追查(chá )他们，希望能得(dé )到解(jiě )药(yào )。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友(yǒu )的下落，被小(xiǎo )兰(lán )撞见的(de )新一情急之下编造了自己名叫(jiào )江户川柯南，随后柯(kē )南寄居在(zài )了小兰家。小兰的(de )父(fù )亲(qīn )毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以(yǐ )籍着和他一(yī )起四出办(bàn )案一起追(zhuī )查黑夜(yè )人的下落。柯南在小学认识步(bù )美等小学生，他(tā )们一起组(zǔ )织了一个少年侦(zhēn )探团(tuán )，向罪犯宣(xuān )战！