工藤新一是(shì )全国著名的高中生侦探，在一次追(zhuī )查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找(zhǎo )到了经常帮助他的阿(ā )笠博士，博士为他度身(shēn )打造不少间谍武(wǔ )器。为了(le )防止犯罪(zuì )团伙对(duì )他进行报(bào )复(fù )，新(xīn )一(yī )决定隐姓埋(mái )名，暗中追查他们，希(xī )望能得到解药。一(yī )日，新一 的女友毛利兰来(lái )到了阿(ā )笠(lì )博(bó )士(shì )的家寻找男友的下落，被小兰(lán )撞见的新一情急之下编(biān )造了自己名叫江户川柯南，随后(hòu )柯南寄居(jū )在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是(shì )一名私(sī )家侦探，新一可(kě )以籍着和他一起(qǐ )四出办(bàn )案一起追查黑夜(yè )人(rén )的下落(luò )。柯南在小(xiǎo )学认(rèn )识(shí )步美等小学生，他们一起组织了(le )一个少年侦探团(tuán )，向(xiàng )罪犯宣战！