工藤新一是全国(guó )著(zhe )名的高中生侦探，在(zài )一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员(yuán )发(fā )现，击晕后喂(wèi )了神奇的药水，工藤新一变(biàn )回了小(xiǎo )孩！新一(yī )找到了经常帮助(zhù )他的阿笠博士，博士为他度身(shēn )打造不少间谍武器。为了(le )防止(zhǐ )犯罪团伙对他进(jìn )行报复(fù )，新一决定隐姓埋名(míng )，暗中(zhōng )追查(chá )他们，希望能(néng )得到解药(yào )。一日，新一 的女友毛利兰来(lái )到了阿笠博士的家寻找男(nán )友的下(xià )落，被小兰撞见的新一情急之(zhī )下编造了自己名(míng )叫江户川柯(kē )南，随后柯南寄居在了小兰(lán )家。小兰(lán )的父亲毛利(lì )小五郎是一名私家侦(zhēn )探，新一可(kě )以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的(de )下(xià )落。柯南在(zài )小学认识步美等小学生(shēng )，他们一起组(zǔ )织了(le )一个少年(nián )侦探团，向罪犯宣战(zhàn )！