工藤新一是全(quán )国著名的高(gāo )中生(shēng )侦探，在一次追查(chá )黑衣人(rén )犯罪(zuì )团伙时不幸被(bèi )团伙成员发现，击(jī )晕后喂了神奇的药水，工藤新一变(biàn )回了(le )小孩！新一找到(dào )了经常(cháng )帮(bāng )助他的阿笠博士，博士(shì )为他(tā )度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报(bào )复，新一决(jué )定隐姓埋名，暗中追查(chá )他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来(lái )到了阿(ā )笠博士的家寻(xún )找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名(míng )叫江(jiāng )户(hù )川柯南，随后(hòu )柯南寄居在(zài )了小兰家。小(xiǎo )兰的父亲毛(máo )利小(xiǎo )五郎是一名(míng )私家侦探，新一可以籍着和他一起(qǐ )四出办案一(yī )起追(zhuī )查黑夜人的下落(luò )。柯南(nán )在小学认识步美等小学生，他们一起组(zǔ )织(zhī )了一个少(shǎo )年侦(zhēn )探团，向罪犯宣战！