工藤新一(yī )是(shì )全(quán )国(guó )著名的(de )高中生侦探，在一次追查黑衣人(rén )犯罪团伙时不幸被团(tuán )伙成员发现，击晕后喂了神奇的(de )药水(shuǐ )，工(gōng )藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助(zhù )他的阿笠博(bó )士(shì )，博士(shì )为他度身打造不少间谍武器。为了(le )防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗(àn )中追查他们，希望(wàng )能(néng )得到解药。一日，新一 的女友(yǒu )毛利兰来到了阿(ā )笠博(bó )士的家寻找男友的下落(luò )，被小兰撞(zhuàng )见的新一(yī )情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后(hòu )柯(kē )南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名(míng )私家侦探(tàn )，新一可以籍着和(hé )他一起四出办案(àn )一起追查黑夜人的(de )下(xià )落(luò )。柯南在小(xiǎo )学认识步美等(děng )小(xiǎo )学生，他们(men )一起组织(zhī )了(le )一个少年侦探(tàn )团，向罪犯宣战！