工藤新一是全(quán )国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂(wèi )了(le )神奇的药水，工(gōng )藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿(ā )笠博士，博士为他度身(shēn )打(dǎ )造不(bú )少间谍武器。为了防止犯罪团伙对(duì )他(tā )进行报复(fù )，新(xīn )一决定隐姓埋名，暗中追查他(tā )们，希望能得到解(jiě )药。一日，新一(yī ) 的女友毛利兰来到了阿笠博(bó )士的(de )家寻找(zhǎo )男友的下落，被小兰撞见的(de )新一情急之下(xià )编(biān )造了自己名叫江户川柯(kē )南，随后柯(kē )南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利(lì )小五郎是(shì )一名私家侦探，新一可以籍着和(hé )他(tā )一起四(sì )出办案(àn )一起(qǐ )追查黑夜(yè )人的(de )下落。柯南(nán )在小学认识步美等小学(xué )生，他们一(yī )起(qǐ )组(zǔ )织了一个少(shǎo )年侦探团，向罪犯宣战！