工(gōng )藤新一(yī )是(shì )全国著(zhe )名的高(gāo )中生侦探(tàn )，在(zài )一次追查黑衣(yī )人犯罪团伙时不幸被团(tuán )伙成员发(fā )现，击(jī )晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新(xīn )一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为(wéi )他度身打造(zào )不(bú )少间谍武(wǔ )器。为了防止犯罪团伙对他进行(háng )报复，新一决定隐(yǐn )姓(xìng )埋(mái )名，暗中追查他们，希望能得到(dào )解(jiě )药。一日，新一 的女友(yǒu )毛(máo )利兰来到了(le )阿笠(lì )博士的家寻找男友的下落，被小(xiǎo )兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一(yī )名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起(qǐ )追查黑夜人的(de )下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织(zhī )了(le )一(yī )个少(shǎo )年侦探团，向罪(zuì )犯(fàn )宣战！