工藤新一是全国著名(míng )的高中生侦(zhēn )探，在一次追查黑(hēi )衣人犯罪(zuì )团伙(huǒ )时不(bú )幸被团伙成员发现，击晕后(hòu )喂了神奇的药水，工藤(téng )新一变(biàn )回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造(zào )不少间谍武(wǔ )器。为(wéi )了(le )防止犯罪团伙对他进行报复，新一决(jué )定隐姓(xìng )埋(mái )名，暗中追(zhuī )查他们，希望能得到(dào )解药。一日，新一 的(de )女友毛利兰来到了(le )阿笠博士的(de )家寻找男友的下落，被(bèi )小兰撞(zhuàng )见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南(nán )寄居(jū )在(zài )了小兰家(jiā )。小兰的父亲毛(máo )利小五郎是一名(míng )私家(jiā )侦探(tàn )，新一可以(yǐ )籍着和他(tā )一起四出(chū )办案一起追查黑(hēi )夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了(le )一个少年侦探团，向罪犯宣战！