工藤新一是全(quán )国著名的高中生侦探，在一次追(zhuī )查(chá )黑衣人(rén )犯罪团(tuán )伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神(shén )奇的药水，工藤新一变(biàn )回了小(xiǎo )孩！新一找到(dào )了经常帮助他的(de )阿笠博士，博士为他度身打造(zào )不少间谍武器(qì )。为了防止犯罪团伙对他(tā )进行报复，新一决定(dìng )隐姓埋名，暗中追查(chá )他们，希望能(néng )得到解药。一日，新(xīn )一 的女友毛利兰(lán )来(lái )到了阿笠博(bó )士的(de )家寻找男友(yǒu )的下落，被小兰撞见的新一情急之下编(biān )造了自己名叫江(jiāng )户川柯南，随后柯南(nán )寄(jì )居在了小兰家。小(xiǎo )兰的父亲(qīn )毛利小五郎是一名私(sī )家侦探，新一可(kě )以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜(yè )人(rén )的下落。柯南在小学认识(shí )步美等小学生(shēng )，他们一起组(zǔ )织了一个少年侦探团，向罪(zuì )犯宣战！