工藤新一是全(quán )国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人(rén )犯罪团伙时(shí )不幸被团伙成员发现，击晕(yūn )后喂了神(shén )奇的药水(shuǐ )，工藤新一(yī )变回了小孩(hái )！新一找到(dào )了经常帮助他(tā )的阿笠(lì )博士(shì )，博士为他度身打(dǎ )造(zào )不少间谍(dié )武器。为了防止(zhǐ )犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋(mái )名，暗(àn )中追查他(tā )们，希望能得到解药。一(yī )日(rì )，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情(qíng )急之下编造(zào )了自己名叫江户川柯南，随后柯南(nán )寄居(jū )在了小兰家。小兰的父亲毛(máo )利(lì )小五郎是一名私家侦探(tàn )，新一可以籍着和他一(yī )起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学生(shēng )，他(tā )们一(yī )起组织了一个(gè )少年侦探团，向罪犯宣战！