工藤(téng )新一是全国著名的高中生(shēng )侦探，在一次追查黑衣人犯罪(zuì )团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂(wèi )了神(shén )奇的(de )药(yào )水，工藤新一变回了小孩(hái )！新一找(zhǎo )到了经常帮助他的(de )阿笠博士(shì )，博士(shì )为他度身打造(zào )不少(shǎo )间谍武器。为(wéi )了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他(tā )们，希望能得到解药。一(yī )日，新一 的女友(yǒu )毛利兰来到(dào )了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急(jí )之下编造(zào )了自(zì )己名(míng )叫江户川柯南，随(suí )后柯南寄居(jū )在了小(xiǎo )兰家(jiā )。小兰(lán )的父亲毛利小五(wǔ )郎是一(yī )名私家侦(zhēn )探，新一(yī )可以籍着和他(tā )一(yī )起四(sì )出办案一起追(zhuī )查黑夜人的下(xià )落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织(zhī )了一个少年(nián )侦探团，向罪犯宣战！