工藤新一是全国著名(míng )的高中生侦探，在一次追查黑(hēi )衣(yī )人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后(hòu )喂了神奇的药(yào )水(shuǐ )，工藤新(xīn )一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士(shì )，博士为他度身打造不少间谍武(wǔ )器。为(wéi )了防止犯罪团伙对他进行报复(fù )，新一决定(dìng )隐姓埋名，暗中追查他们，希(xī )望能得到(dào )解药。一日，新一 的女友毛利(lì )兰来到(dào )了阿笠博士的家寻找(zhǎo )男友的(de )下落，被小兰撞(zhuàng )见的新一情急之下编造了自己名叫江(jiāng )户川柯南(nán )，随后(hòu )柯(kē )南寄居在了小兰(lán )家(jiā )。小兰的父(fù )亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着(zhe )和他一(yī )起四出办案一起(qǐ )追查(chá )黑夜人的下落。柯南(nán )在(zài )小学(xué )认识步(bù )美(měi )等小学生，他们一起组织了一个(gè )少年侦探团，向罪(zuì )犯宣(xuān )战！