工藤新一是全国著名的高中生侦探，在(zài )一次追查黑衣(yī )人犯罪团伙时不幸被团伙成员发(fā )现，击晕后喂了神奇的药水(shuǐ )，工藤新一变回了(le )小孩！新一找到了经(jīng )常帮(bāng )助他(tā )的阿笠博士(shì )，博士(shì )为他度(dù )身打造不少间(jiān )谍武(wǔ )器。为(wéi )了(le )防止犯罪团伙对他进行(háng )报复，新一(yī )决(jué )定隐姓埋名，暗中追查他(tā )们，希(xī )望能(néng )得到解药。一日，新(xīn )一 的女友毛利(lì )兰来到了阿(ā )笠(lì )博士(shì )的家寻找男友的下(xià )落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己(jǐ )名(míng )叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小(xiǎo )兰家。小兰的父亲毛利(lì )小(xiǎo )五郎是一名私家(jiā )侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南(nán )在小学(xué )认识步美等小(xiǎo )学生，他们一起组织了一个少(shǎo )年侦探(tàn )团，向罪犯宣战(zhàn )！