工藤新一是全国著(zhe )名的高中生侦(zhēn )探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被(bèi )团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤(téng )新一变回了小孩！新一(yī )找到了经常帮助他的(de )阿笠博士，博士为(wéi )他(tā )度身打造不少(shǎo )间(jiān )谍武器。为了防(fáng )止犯罪团伙对他进行(háng )报(bào )复，新一决定隐姓(xìng )埋名，暗中追(zhuī )查他们，希望能得到解(jiě )药。一日，新一 的(de )女友毛(máo )利(lì )兰来到了阿笠博(bó )士的家寻找男友的下落，被小(xiǎo )兰撞见(jiàn )的新一(yī )情急(jí )之下(xià )编造了自己名叫江户川柯南(nán )，随后柯南寄居在(zài )了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家(jiā )侦探，新一可以籍(jí )着(zhe )和(hé )他一起四出办案一(yī )起(qǐ )追查(chá )黑夜人的下落(luò )。柯(kē )南在小学认识步美等小学生，他们一(yī )起组织了一(yī )个少年侦探团，向罪犯宣(xuān )战！