工(gōng )藤(téng )新一是(shì )全国著名的高中生侦探，在一(yī )次(cì )追查黑(hēi )衣(yī )人犯(fàn )罪团伙时不幸被团(tuán )伙成员发现，击晕后喂(wèi )了(le )神奇的药水，工藤新一变回了(le )小(xiǎo )孩(hái )！新一找到了经常帮助他(tā )的阿笠博士(shì )，博(bó )士为(wéi )他度身打造(zào )不少间谍(dié )武(wǔ )器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新(xīn )一决定隐姓埋名，暗中追查(chá )他们，希望能得到解药。一日，新一(yī ) 的女友毛利兰来到了阿笠博士(shì )的家寻找男(nán )友的下落，被小兰撞见(jiàn )的新一情(qíng )急之下编造了自己名叫(jiào )江(jiāng )户川柯南，随后柯南寄居在了小(xiǎo )兰家。小兰的父亲毛利(lì )小五(wǔ )郎是一名私家侦探(tàn )，新一可以籍着和他一起四(sì )出办案一起(qǐ )追(zhuī )查黑夜(yè )人的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！