工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追(zhuī )查(chá )黑衣人犯罪团伙时不幸被团(tuán )伙(huǒ )成员发现，击晕后喂了神奇的药水(shuǐ )，工藤新(xīn )一变回了小孩(hái )！新一找到了经常帮助他(tā )的阿笠博士，博士为(wéi )他度身打造不少(shǎo )间谍武器。为了(le )防止犯罪团伙对他进行(háng )报(bào )复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望(wàng )能得到(dào )解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了(le )阿笠博士的家寻找男(nán )友的下落，被小兰撞见的新一情急(jí )之下编造了(le )自己名叫江户川(chuān )柯南，随后柯南(nán )寄居在(zài )了(le )小兰家。小(xiǎo )兰的(de )父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新(xīn )一可(kě )以(yǐ )籍着和(hé )他一起四出办案一起(qǐ )追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学(xué )生，他们一起组织了(le )一(yī )个少年(nián )侦探团，向罪犯(fàn )宣战！