工(gōng )藤新一(yī )是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被(bèi )团伙成(chéng )员(yuán )发现，击晕后喂了神奇(qí )的药水(shuǐ )，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为(wéi )他度身打造不少间谍(dié )武器。为(wéi )了防止犯罪团伙对他进(jìn )行报复，新一决定隐(yǐn )姓埋名，暗中追(zhuī )查他们，希望(wàng )能得到解药(yào )。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的(de )家寻(xún )找男友(yǒu )的下落(luò )，被小兰撞见的新(xīn )一情急之下编造(zào )了自己名叫江户(hù )川柯南，随(suí )后(hòu )柯南寄(jì )居在了(le )小(xiǎo )兰家。小(xiǎo )兰的父亲毛(máo )利小五郎是一名(míng )私家(jiā )侦探，新(xīn )一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人(rén )的(de )下落。柯南在小学认(rèn )识步美等小(xiǎo )学生，他们一起组织了一个少年侦探(tàn )团，向罪犯宣(xuān )战！