工(gōng )藤新一(yī )是全(quán )国著名的高(gāo )中(zhōng )生侦探，在一次追查(chá )黑(hēi )衣(yī )人(rén )犯罪团伙(huǒ )时不幸被团伙成(chéng )员发现，击晕后喂了神奇的(de )药水，工藤(téng )新一变回了小孩！新一找到了经(jīng )常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯(fàn )罪团伙对他进行报复，新一决定(dìng )隐(yǐn )姓埋名，暗(àn )中(zhōng )追查他们，希望能(néng )得(dé )到解药。一日，新一 的女(nǚ )友毛(máo )利兰来到了阿(ā )笠博士的家(jiā )寻找(zhǎo )男友的(de )下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了(le )自己名叫江户川柯南，随后(hòu )柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五(wǔ )郎是一名(míng )私家侦探，新一可以籍着和他一起(qǐ )四出办案一起追查黑夜人(rén )的(de )下(xià )落。柯南在(zài )小学认识步美等小学生，他们(men )一起(qǐ )组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战(zhàn )！