工藤新一是全国著(zhe )名的高中生侦探，在一次追查黑衣人(rén )犯(fàn )罪团(tuán )伙时不幸被团伙(huǒ )成员(yuán )发现，击(jī )晕后喂(wèi )了神(shén )奇的(de )药(yào )水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他(tā )的(de )阿笠博士，博士(shì )为(wéi )他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪(zuì )团伙对他进行报复，新(xīn )一决(jué )定(dìng )隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到(dào )解(jiě )药。一日(rì )，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞(zhuàng )见的新一情急之下编造(zào )了(le )自己名叫江户川柯南(nán )，随(suí )后(hòu )柯南寄居在了小兰家。小兰的(de )父亲毛(máo )利(lì )小五(wǔ )郎是一名私家侦探，新一(yī )可以(yǐ )籍着和他一起(qǐ )四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团(tuán )，向罪犯宣战！