工藤新一是全国著名(míng )的高中(zhōng )生侦探，在一次追查黑(hēi )衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现(xiàn )，击晕(yūn )后喂了神奇的药水(shuǐ )，工藤新一(yī )变回了小孩(hái )！新一找到了经常帮助他的阿(ā )笠博士，博士为他(tā )度身打造不少间谍武(wǔ )器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐(yǐn )姓埋名，暗中追(zhuī )查他们，希望能得到解药。一日(rì )，新一(yī ) 的女友毛利兰来到了(le )阿笠(lì )博士的家寻找男友的下落，被(bèi )小兰撞见的(de )新一情急(jí )之(zhī )下编造了自己名叫(jiào )江户川柯南，随后(hòu )柯南寄居(jū )在了小兰家。小(xiǎo )兰的父亲毛利(lì )小(xiǎo )五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他(tā )一起四出办案一起追查黑夜人的下落(luò )。柯南在(zài )小学认识步美等小(xiǎo )学生，他(tā )们一(yī )起(qǐ )组织了(le )一个(gè )少(shǎo )年侦探(tàn )团，向罪犯宣战！