工藤新一是(shì )全国著名的高中生侦探，在一次(cì )追(zhuī )查黑衣人犯(fàn )罪团伙时(shí )不幸被(bèi )团伙(huǒ )成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工(gōng )藤新一变回了小(xiǎo )孩(hái )！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士(shì )为他度(dù )身打造不少间谍武器。为了防止(zhǐ )犯罪团伙对他(tā )进(jìn )行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追(zhuī )查他们(men )，希望能得到解(jiě )药。一(yī )日，新一(yī ) 的女友毛利兰来到了阿(ā )笠博士(shì )的(de )家寻找男友的下(xià )落，被小兰撞见(jiàn )的新一情(qíng )急之下编造了自己名(míng )叫江户川柯南，随后柯南(nán )寄居在(zài )了小兰家。小兰的父(fù )亲毛(máo )利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小(xiǎo )学认识步(bù )美等(děng )小(xiǎo )学生，他们一起组织了一个少年侦探(tàn )团，向罪犯宣战！