工藤新一是全国著名(míng )的高中生侦探(tàn )，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员(yuán )发(fā )现，击晕后喂了神奇的药(yào )水，工藤新一变(biàn )回了小孩！新(xīn )一找到(dào )了经常帮助(zhù )他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器(qì )。为了防止(zhǐ )犯罪(zuì )团伙对(duì )他进行报复(fù )，新一决定隐姓埋(mái )名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友(yǒu )毛利兰来(lái )到(dào )了阿笠博士的家寻找(zhǎo )男友的下落，被(bèi )小兰撞见的新一情急(jí )之下编造了自己名叫江户川(chuān )柯(kē )南，随后柯南寄(jì )居(jū )在(zài )了小兰家。小兰的父亲毛利小(xiǎo )五(wǔ )郎是一名私家侦(zhēn )探，新一可以籍着和(hé )他一起四出办案一起追查黑夜(yè )人(rén )的下落(luò )。柯南在小学(xué )认识(shí )步美(měi )等(děng )小(xiǎo )学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！