工藤新一是全国著名的高中(zhōng )生侦探，在一次追查(chá )黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕(yūn )后(hòu )喂了神奇的(de )药水(shuǐ )，工藤新一变回了小孩(hái )！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博(bó )士为他度(dù )身打造(zào )不少间(jiān )谍武器。为了防止(zhǐ )犯罪团伙对他进行报复，新一(yī )决(jué )定隐姓埋名，暗中追查他(tā )们，希望(wàng )能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠(lì )博士(shì )的(de )家寻找男友(yǒu )的下落，被小兰撞见的新(xīn )一情(qíng )急之(zhī )下编造了自己名叫江户川柯南(nán )，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父(fù )亲毛利小五郎(láng )是(shì )一(yī )名私家(jiā )侦探，新一可以籍着和他(tā )一起四出办案一起追查(chá )黑夜人的下落。柯南(nán )在小学(xué )认识步美等(děng )小学生，他们一起组织了一个(gè )少年侦(zhēn )探团，向罪(zuì )犯宣战(zhàn )！