工藤新一是全(quán )国著名的高中生侦探(tàn )，在一次追查黑衣人犯罪团(tuán )伙时不幸被团伙(huǒ )成(chéng )员发现，击晕后(hòu )喂(wèi )了神(shén )奇的药水(shuǐ )，工藤新一变(biàn )回(huí )了(le )小孩！新一找(zhǎo )到了经常帮助他的阿笠博士(shì )，博士(shì )为他度身打造不少间谍武(wǔ )器。为了防止犯罪团伙对他(tā )进行报复，新一(yī )决定隐姓埋名，暗中追查他(tā )们，希望能得(dé )到解药(yào )。一日(rì )，新一 的(de )女友毛利兰来到了阿笠博士的(de )家寻找男友的下落，被(bèi )小兰撞见(jiàn )的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随(suí )后柯南寄(jì )居(jū )在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私(sī )家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑(hēi )夜(yè )人的下落。柯南在(zài )小学认识(shí )步美等小学生，他(tā )们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯(fàn )宣战(zhàn )！