工(gōng )藤新(xīn )一(yī )是(shì )全国著名的高中生侦探，在(zài )一(yī )次追查黑衣人犯罪团伙(huǒ )时不幸被团伙(huǒ )成(chéng )员发现，击晕后(hòu )喂了神奇的药水(shuǐ )，工藤新一变回了小孩！新一找到了(le )经常(cháng )帮助他的阿笠博士，博士为他(tā )度身打造不少间(jiān )谍武器。为了防止犯(fàn )罪团(tuán )伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗(àn )中追查(chá )他们，希望能得(dé )到解药。一日，新一 的女友毛利(lì )兰来到了阿笠博士(shì )的家寻找(zhǎo )男(nán )友的下落，被(bèi )小(xiǎo )兰撞见的新一情急(jí )之下(xià )编造了自己名叫江户川柯南(nán )，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的(de )父亲毛利(lì )小五郎是一名私家侦探，新一可以(yǐ )籍着和(hé )他一起四出办案一(yī )起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美(měi )等小学生(shēng )，他们一(yī )起组织了一(yī )个少年侦探团，向罪犯宣战！