工藤新一是全国(guó )著名的高中(zhōng )生侦探，在一次(cì )追查黑衣人犯(fàn )罪团伙时不幸被团伙成员发现，击(jī )晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了(le )小孩(hái )！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打(dǎ )造不少(shǎo )间(jiān )谍武器。为了(le )防止犯罪(zuì )团伙对他进行报复，新一决定(dìng )隐姓埋名(míng )，暗中追查他们(men )，希望能得到解(jiě )药。一日，新一 的女友(yǒu )毛利兰来到了(le )阿笠博(bó )士的(de )家寻找男友的下落，被小兰撞(zhuàng )见的新一情急(jí )之下(xià )编造了自(zì )己(jǐ )名(míng )叫江户川柯南，随(suí )后柯南寄居在了小兰家。小兰的(de )父亲毛利小五郎是一名私(sī )家侦探，新一(yī )可以(yǐ )籍着和他一起四(sì )出(chū )办案一起追查黑(hēi )夜人的下落。柯南在小学(xué )认识步美等小学生，他们一(yī )起组织了一个少年侦探团，向罪(zuì )犯(fàn )宣战！