工藤新一是全(quán )国(guó )著名的高中生侦探，在(zài )一次追查黑衣人(rén )犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕(yūn )后喂了神奇的(de )药水，工(gōng )藤新一(yī )变回了小(xiǎo )孩！新一找到了经(jīng )常帮助(zhù )他的阿笠博士，博士为他度(dù )身打造不少(shǎo )间(jiān )谍(dié )武器(qì )。为了防止犯罪(zuì )团(tuán )伙对(duì )他进行报(bào )复，新(xīn )一决定隐姓(xìng )埋名，暗中追查他(tā )们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠(lì )博士的家寻找男(nán )友的下(xià )落，被小兰撞见的新一(yī )情急之(zhī )下编造了(le )自(zì )己名叫江户川柯南，随(suí )后柯南(nán )寄居在了小兰家(jiā )。小兰的父(fù )亲毛利小(xiǎo )五郎是一名私家(jiā )侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认(rèn )识步美等小学生(shēng )，他(tā )们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！