工藤新一是全国著(zhe )名(míng )的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药(yào )水，工(gōng )藤新(xīn )一变(biàn )回了小孩(hái )！新一找到了经常帮助他的阿笠博(bó )士，博士为(wéi )他度身打造不少间谍武器。为了(le )防止犯(fàn )罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋(mái )名，暗中追查(chá )他们，希望能得到解药。一日，新(xīn )一(yī ) 的女友毛利兰来到(dào )了阿笠博士的家寻找男友的下(xià )落，被小兰撞见的新一(yī )情急之(zhī )下编造了(le )自己名叫江户(hù )川柯南(nán )，随后柯(kē )南寄居(jū )在(zài )了小兰(lán )家。小兰(lán )的(de )父亲毛利小五郎(láng )是一名私家侦探，新一可以籍(jí )着和他一起四出(chū )办案(àn )一起追(zhuī )查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们(men )一(yī )起组织了一个少年侦探(tàn )团(tuán )，向(xiàng )罪犯宣战！