工藤新一是全国(guó )著名的高中生侦(zhēn )探，在一次追查黑衣人犯罪(zuì )团(tuán )伙时不幸被团伙成(chéng )员发现，击晕后喂(wèi )了神奇的药水，工藤新一(yī )变回了小孩！新一找(zhǎo )到了经常帮(bāng )助他的阿笠博士，博士为他度身打(dǎ )造不少间谍武(wǔ )器。为了(le )防止犯罪团伙对他进行报复，新一(yī )决定(dìng )隐(yǐn )姓埋名，暗中(zhōng )追查他们，希望能(néng )得到解药。一日，新一 的女友毛(máo )利(lì )兰(lán )来到了阿笠博士的家寻找(zhǎo )男(nán )友的(de )下落，被小兰撞见(jiàn )的新一情急(jí )之下编造了自己名叫江户川柯南，随(suí )后柯南寄居在了小兰家。小兰(lán )的父(fù )亲毛利(lì )小(xiǎo )五郎是(shì )一(yī )名私家侦探，新一可以籍着和他一起四(sì )出办案一起追(zhuī )查(chá )黑夜人的下落。柯南在小(xiǎo )学认(rèn )识步(bù )美等(děng )小学生，他们一起组织了一个少年侦探(tàn )团，向罪犯宣战！