工藤(téng )新一是全(quán )国著名的高中生侦探，在(zài )一次追(zhuī )查黑衣人犯罪团伙时不幸(xìng )被团(tuán )伙(huǒ )成员发现(xiàn )，击晕后喂了神奇的药(yào )水，工藤新一(yī )变回(huí )了(le )小孩！新一找到了经常帮助(zhù )他的阿笠(lì )博(bó )士，博士(shì )为他(tā )度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙(huǒ )对他进行报复，新一决定隐姓(xìng )埋名(míng )，暗中追查(chá )他(tā )们(men )，希望能得到解药(yào )。一日，新一 的女(nǚ )友毛利兰来到了阿(ā )笠博士(shì )的家寻找(zhǎo )男友的下落，被小兰撞见的新一情急(jí )之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居(jū )在了小兰(lán )家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦(zhēn )探，新一可以籍着和他一起四出办(bàn )案一起追查黑夜人的(de )下落。柯南(nán )在小学认识步美(měi )等小学生，他们一起组织了一个少(shǎo )年侦探团，向罪犯宣(xuān )战！