工藤新一是全国著(zhe )名的高中生侦探，在(zài )一次追查黑衣人犯(fàn )罪团伙(huǒ )时不幸(xìng )被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药(yào )水，工藤新一(yī )变回了小孩！新一找到了经常帮助(zhù )他的阿笠博(bó )士，博士为他度(dù )身打造(zào )不少间谍武(wǔ )器。为了防(fáng )止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐(yǐn )姓埋名，暗(àn )中追(zhuī )查他们(men )，希望能得到解药(yào )。一日，新一 的(de )女友毛利(lì )兰来到了阿笠博士的家寻找男(nán )友的下落，被小兰撞见的新(xīn )一情急之下编造了自(zì )己名叫江(jiāng )户川柯南，随(suí )后柯南寄居在(zài )了小兰家。小兰的父亲毛(máo )利小五郎是一名私家侦探，新一可(kě )以籍着和(hé )他一(yī )起四(sì )出办案一起追查黑夜人的(de )下(xià )落。柯南(nán )在小学认识步(bù )美等小学生(shēng )，他(tā )们一起组织了一个(gè )少年侦探团，向罪犯宣战！