工(gōng )藤新一是全国著名(míng )的高中生侦探(tàn )，在一次追查黑衣人犯罪团伙时(shí )不(bú )幸被团伙成(chéng )员发现，击晕(yūn )后喂(wèi )了神奇的(de )药水，工藤新(xīn )一变回了小(xiǎo )孩！新一找到了经常帮助他的阿笠(lì )博士，博士为(wéi )他度身打造不少间谍武器。为了防止(zhǐ )犯罪团伙对他(tā )进(jìn )行(háng )报复，新一决定隐姓埋名，暗中(zhōng )追查他(tā )们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博(bó )士的家寻找(zhǎo )男友的(de )下落，被小兰撞见的新一情(qíng )急之下编造(zào )了自己名叫江户川柯南(nán )，随后(hòu )柯南寄居在了小兰家。小兰的(de )父亲毛利小五郎是一名私家(jiā )侦探，新一可以籍(jí )着和(hé )他一起四出办案一起追查黑夜(yè )人的下落。柯(kē )南在(zài )小学认(rèn )识(shí )步美等小学生，他们(men )一起组织了一个(gè )少年侦探(tàn )团，向罪(zuì )犯宣战！