工藤新一是全国著(zhe )名的高(gāo )中生侦探，在一(yī )次(cì )追查黑衣人犯(fàn )罪(zuì )团(tuán )伙时不幸(xìng )被团伙成员发(fā )现，击晕后喂了神奇的药水，工藤(téng )新一变回(huí )了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠(lì )博士(shì )，博士为他度身打造不少(shǎo )间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复(fù )，新一决定(dìng )隐(yǐn )姓埋名，暗(àn )中(zhōng )追查他们，希望能得(dé )到解药。一日，新一 的女友毛利兰(lán )来到了阿笠博(bó )士的家寻找男友(yǒu )的下(xià )落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫(jiào )江(jiāng )户川柯南，随后柯南寄居在了(le )小兰家。小兰的父亲(qīn )毛利小五郎是一(yī )名私(sī )家侦探，新一可(kě )以籍(jí )着(zhe )和他一起四出(chū )办案(àn )一起追查黑夜人的下落。柯南在(zài )小学(xué )认识步美等小(xiǎo )学生，他(tā )们(men )一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！