工藤(téng )新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪(zuì )团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇(qí )的药水，工藤新一(yī )变回了小孩！新(xīn )一找(zhǎo )到了经(jīng )常帮助他(tā )的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍(dié )武(wǔ )器。为了防止犯罪团伙对(duì )他进行报复，新一决定(dìng )隐姓埋名，暗中追(zhuī )查(chá )他们，希(xī )望能得到解药。一(yī )日，新一 的女友毛利兰来到了(le )阿笠博士(shì )的家寻找男友的下落(luò )，被小兰撞见(jiàn )的新一情急(jí )之下编造了(le )自己名叫江户川(chuān )柯南，随(suí )后(hòu )柯南寄(jì )居(jū )在了(le )小兰家。小兰的父亲毛(máo )利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一(yī )起追查黑夜人的下落。柯南在小学(xué )认识(shí )步美(měi )等小学生，他(tā )们一起组织了一个少(shǎo )年侦探团，向罪(zuì )犯宣战(zhàn )！