工(gōng )藤新一是全国著(zhe )名的高中生侦(zhēn )探，在一次追查黑(hēi )衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击(jī )晕后喂(wèi )了神奇的药水，工藤新一变回了小孩(hái )！新一找到了经常(cháng )帮助(zhù )他的阿笠博士，博士为他度(dù )身打造不少间谍(dié )武器。为了防止(zhǐ )犯(fàn )罪团伙对他进行(háng )报(bào )复，新一(yī )决定隐姓(xìng )埋名，暗中追查他们，希(xī )望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的(de )下落，被(bèi )小兰撞(zhuàng )见(jiàn )的新一情急之(zhī )下编造了自己名叫江户川(chuān )柯南，随后(hòu )柯南寄居在了(le )小(xiǎo )兰家。小兰的父亲(qīn )毛利小五郎是一名私家侦探，新一(yī )可以籍着和他一起四出(chū )办案一(yī )起追查黑(hēi )夜人(rén )的下落。柯南在(zài )小学认(rèn )识步美等小(xiǎo )学生，他们(men )一(yī )起组织(zhī )了一个少年侦探团，向罪犯(fàn )宣战！