工藤新一是全国著名的(de )高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪(zuì )团伙时(shí )不幸被团伙成员发(fā )现，击晕后喂(wèi )了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的(de )阿笠(lì )博士，博士为(wéi )他度身打造不少间谍(dié )武器。为了防止(zhǐ )犯罪团伙对他进行(háng )报复(fù )，新(xīn )一决定隐(yǐn )姓埋名，暗(àn )中(zhōng )追查他们，希望能得到解药。一日，新一 的女(nǚ )友毛(máo )利兰来(lái )到了阿(ā )笠博士(shì )的(de )家寻找男友的下落，被小兰撞见的新(xīn )一(yī )情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居(jū )在(zài )了小兰家(jiā )。小兰的父亲毛利小五郎是(shì )一名私(sī )家侦探，新一可(kě )以籍着和他一起四出办(bàn )案一(yī )起追查黑夜人(rén )的(de )下落。柯南在小学(xué )认识步美等小学生，他们一起组织了一个(gè )少年侦探团(tuán )，向罪犯宣战！